Misvísandi contigs eru til staðar í tilvísunargenómum með umtalsverðum hraða (td 1% í músarviðmiðunargeni). Strand-seq, á meðan hefðbundnar raðgreiningaraðferðir eru, geta afhjúpað þessar rangar vísindagreiningar. Misvísandi samsambönd eru til staðar þar sem erfðaréttur strandar breytist frá einu arfhyrndu ástandi til annars (td WW til CC, eða CC til WW). Að auki er þessi ástandsbreyting sýnileg í hverju Strand-seq bókasafni, sem styrkir tilvist misoriented contig.
Að bera kennsl á óeðlilegar aðgreiningar systur litskilja
Fyrir sjöunda áratug síðustu aldar var gert ráð fyrir að systur litskiljanir væru aðgreindar af handahófi í dótturfrumur. Samt sem áður hefur sést aðgreining á systur litskiljunum í slembirönum síðan. Nokkrar tilgátur hafa verið lagðar til að skýra aðskilnaðinn, sem ekki er tilviljanakenndur, þar á meðal ódauðlegan Strand-stálsstopp og hljóðláta systur staðsetninguna, sem ein vonandi verður að sannreyna með aðferðum sem taka þátt í Strand-seq.
Tilgáta um ódauðlegt strönd
Mynd 263A | Framleiðsla BAIT, sem sýnir lestur telja bæði fyrir Watson (W, grænt) og Crick (C, blátt) þræði. Hver lesin upptalningarslá sýnir fjölda greininga í takt við tiltekna 200 kb bin af viðmiðunargeninu. Héðan er ályktað um arf fyrir foreldra sniðmátsstrengja. Svo sem ef bæði afrit af 200 kb litningahluta í dótturfrumunni voru samin úr Watson sniðmát þræðir í móðurfrumunni, væri þetta táknað með stórum grænum stöng sem gefur til kynna eingöngu W röðun á því litningasvæði. Skiptir á milli arfhreinir og arfblendnir ríki í arf sniðmátsstrengja eru einnig túlkaðir sem systur chromatid ungmennaskipti (SCE). | Maia.smith / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Bioinformatic_Analysis_of_Inherited_Templates_(BAIT)_Output.png) from Wikimedia Commons
Höfundur : Yavor Mendel
Ummæli
Skrifa ummæli