Gríðarlega samhliða undirskrift röð (MPSS)

Fyrsta af afkastagetu raðgreiningartækninnar, gegnheill samsíða raðgreiningar (eða MPSS), var þróuð á tíunda áratugnum hjá Lynx Therapeutics, fyrirtæki stofnað árið 1992 af Sydney Brenner og Sam Eletr. MPSS var aðgerð sem byggir á complex perlum sem notaði complex til að vera complex tenging við millistykki fyrir millistykki fylgt eftir með afkóðun millistykki, þar sem lesa átti samsöfnunina í þrepum fjögurra kirna. Þessi aðgerð gerði það næmt fyrir röð sértækrar hlutdrægni eða tap á sérstökum röð. Í tilefni af því að tæknin var svo complex var MPSS aðeins framkvæmt "í húsi" af Lynx Therapeutics og engin DNA raðgreiningarvélar voru seldar til óháðra rannsóknarstofa. Lynx Therapeutics sameinaðist Solexa (seinna keypt af Illumina) árið 2004, sem leiddi til þróunar raðgreiningar við nýmyndun, einfaldara að vera í boði Manteia Predictive Medicine, sem gerði MPSS úrelt. Hvað sem því líður voru nauðsynlegir eiginleikar MPSS framleiðslunnar dæmigerðir fyrir síðari gagnaflutningagerðir, þar á meðal hundruð þúsunda stuttra DNA röð. Í tilviki MPSS voru þetta venjulega notuð til að raðgreina cDNA til mælinga á genaformi tjáningarstiga.

Mynd 151A | Setja þarf saman margar, sundurlausar sameiningargreiningar saman á grundvelli skarast svæða þeirra. | Suspencewl / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mapping_Reads.png) frá Wikimedia Commons

Mynd 151A | Setja þarf saman margar, sundurlausar sameiningargreiningar saman á grundvelli skarast svæða þeirra. | Suspencewl / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mapping_Reads.png) frá Wikimedia Commons

Höfundur : Milos Pawlowski

Tilvísanir:

Sameindalíffræði Tækni

Tækni sameindalíffræði II

Ummæli