Röðun í stórum stíl og de novo raðgreining

Í stórum stíl raðgreining miðar oft að því að DNA raðsetja mjög langa DNA verk, eins og sýnt er af heilum litningum, þrátt fyrir að stórar raðgreiningar séu á svipaðan hátt hægt að nota til að búa til mjög stóran fjölda stuttra röð, eins og sýnt er í phage display. Fyrir lengri markmið eins og sést með litningum samanstendur algengar aðferðir af því að skera (með takmörkun ensíma) eða klippa (með vélrænum kröftum) stórum DNA brotum í styttri DNA brot. Hægt er að klóna brotakennda DNA í DNA vektor og magna í bakteríuhýsi eins og sýnt er af Escherichia coli. Stutt DNA brot hreinsuð úr einstökum gerlaþyrpingum eru gefin til marks um röð og sett saman rafrænt í eina langa, samfellda samsöfnun. Rannsóknir hafa sýnt að með því að bæta við DNA stærðarvalskrefi til að safna DNA brotum af einsleitri stærð getur það bætt verkun og nákvæmni erfðamengjasamsetningarinnar. Í þessum rannsóknum hefur sjálfvirk límvatn reynst vera fjölföldun og nákvæmari en handstærð hlaupstærð.

Mynd 149A | Dæmi um niðurstöður sjálfvirkrar DNA röðunar keðjuuppsagnar. | Abizar á ensku Wikipedia / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Radioactive_Fluorescent_Seq.jpg) frá Wikimedia Commons

Mynd 149A | Dæmi um niðurstöður sjálfvirkrar DNA röðunar keðjuuppsagnar. | Abizar á ensku Wikipedia / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Radioactive_Fluorescent_Seq.jpg) frá Wikimedia Commons

Höfundur : Milos Pawlowski

Tilvísanir:

Sameindalíffræði Tækni

Tækni sameindalíffræði II

Ummæli