Tvær aðferðir eru notaðar við að útbúa sniðmát fyrir NGS viðbrögð: magnað sniðmát sem er upprunnið frá stökum DNA sameindum og stökum DNA sameindasniðmátum. Fyrir myndgreiningarkerfi sem geta ekki lent í einstökum flúrljómunartilvikum er krafist DNA magnunar á DNA sniðmátum. Þrjár algengustu PCR magnunaraðferðirnar eru fleyti PCR (emPCR), veltihringur og fastfasa magnun. Endanleg dreifing sniðmáta getur verið staðbundin af handahófi eða á töflu.
Fleyti PCR
Í fleyti PCR aðferðum er DNA bókasafn fyrst búið til með handahófi sundrungu á erfðaefni DNA. Single-strandaði DNA Brotin (sniðmát) eru fest við yfirborð kyrnum með millistykki eða tengihópar, og einn bead er tengt við eitt DNA broti úr the DNA bókasafn. Yfirborð DNA perlanna inniheldur fákirni prófanir með röð sem eru viðbót við DNA aðlögunartækin sem binda DNA brotin. Perlurnar eru síðan hólfaðar niður í vatns-olíu fleyti dropar. Í vatns-vatns-olíu fleyti, hver dropi sem tekur eina perlu er PCR örsprauta sem framleiðir magnaða eintök af staka DNA sniðmátinu.
Mynd 155A | PacBio SMRT tækni og Oxford Nanopore geta notað óbreytt DNA til að mæta metýleringu. | Nivretta Thatra / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:3rd_gen_Epigenetics.png) frá Wikimedia Commons
Höfundur : Yavor Mendel
Ummæli
Skrifa ummæli