Mismunur á milli snRNA-seq og scRNA-seq

SnRNA-seq notar einangraða kjarna frekar allar frumurnar til að mynda tjáningarform gena. Það er að segja, scRNA-seq mælir bæði umfrymis- og kjarnafrit, hins vegar snRNA-seq mælir náttúrulega kjarnafrit (þó að einhver afrit styrks sé fest við gróft reticulum endófléttu og að hluta varðveitt í kjarnaframleiðslu). Þetta gerir snRNA-seq kleift að halda áfram aðeins kjarnanum en ekki öllu frumunni. Af þessum sökum, samanborið við scRNA-seq, er snRNA-Seq heppilegra til að mynda tjáningarform gena í frumum sem erfitt er að einangra (td fitufrumur, taugafrumur), auk þess sem varðveittir vefir.

Að auki er hægt að fá kjarna sem þarf til snRNA-seq fljótt og auðveldlega úr ferskum, léttum fastum eða frosnum vefjum, meðan einangrun frumna fyrir einfrumu RNA-seq( scRNA-seq) felur í sér langan ræktun og vinnslu. Þetta veitir vísindamönnum hæfileika til að fá afrit sem eru ekki eins hrærð við einangrun.

Mynd 271A | Grunn snRNA-Seq tilraunir sem ekki nota DroNC-Seq vinnuflæði myndu fylgja samskiptareglur svipaðar þessari | Simkrai / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Basic_snRNA-Seq_Workflow.png) from Wikimedia Commons

Höfundur : Yavor Mendel

Tilvísanir:

Sameindalíffræði Tækni II

Tækni sameindalíffræði VI