Samsett greining á takmörkun á bisulfite

Samsett rannsókn á bisulfite takmörkun (eða COBRA) er sameindalíffræðiaðferð sem gerir kleift að viðkvæma magn DNA metýleringarmagns við tiltekið erfðamengi locus á DNA samsöfnun í litlu sýni úr erfðaefni DNA. Tæknin er afbrigði af bisulfite röð og sameinar bisulfite umbreytingu byggð fjölliðu keðjuverkun við takmörkun meltingar. Upprunalega þróað til að meðhöndla áreiðanlegt magn af erfðaefni DNA úr DNA örsönnuðum parafíngræddum vefjasýnum. Aðferðin hefur síðan séð víðtæka notkun í krabbameinsrannsóknum og rannsóknum á erfðaefni.

Mynd 137A | Fyrstu skrefin af COBRA og sameindabreytingarnar sem valda hverju þrepi á metýleruðu og ómetýleruðu CpG stöðum. | Jujubix / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Cobra_workflow.svg) frá Wikimedia Commons

Heldur áfram

Bisulfite meðferð

Genomic DNA sem sóst er meðhöndluð með natríum bisúlfit, sem kynnir metýlering-háð samtenging munur. Meðan á natríumbísúlfítmeðferð stendur er ómetýleruðum cýtósínleifum breytt í uracil en metýleraðar cýtósínleifar hafa ekki áhrif.

Mynd 137A | Fyrstu skrefin af COBRA og sameindabreytingarnar sem valda hverju þrepi á metýleruðu og ómetýleruðu CpG stöðum. | Jujubix / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Cobra_workflow.svg) frá Wikimedia Commons

Höfundur : Milos Pawlowski

Tilvísanir:

Sameindalíffræði Tækni

Tækni sameindalíffræði II