SMRT raðgreining byggir á því að raðgreiningin er búin til. The DNA myndast í núll-ham bylgju-handbækur (ZMWs) - lítið vel eins gámum með þeim handtaka verkfærum staðsett á the botn af the heilbrigður. Röðunin er framkvæmd með því að nota óbreytta fjölliðu (fest við ZMW botninn) og flúrljóst merktum kirni sem flæða frjálslega í lausninni. Holurnar eru smíðaðar á þann hátt að aðeins flúrljómun sem kemur fram við botn holunnar er greind. Flúrljómandi merkimiðinn er aðskilinn frá núkleótíði þegar hann er felldur í DNA strenginn og skilur eftir óbreytta DNA strandar. Samkvæmt Pacific Biosciences (PacBio), SMRT tækni verktaki, gerir þessi aðferð kleift að greina breytingar á núkleótíðum (svo sem cýtósínmetýleringu). Þetta gerist með athugasemdinni um hreyfiorku fjölliðu. Þetta er til staðar gerir kleift að greina 20, 000 núkleótíð eða meira, með meðaltal aflestarlengdanna 5 kilobasar. Árið 2015 tilkynnti Pacific Biosciences að ráðist yrði á nýjan raðgreiningartæki sem kallast Sequel System, með 1 milljón ZMW samanborið við 150, 000 ZMW í PacBio RS II tækinu. SMRT raðgreining er nefnd "þriðja kynslóð" eða "löng lestur" röð.
Mynd 151A | Setja þarf saman margar, sundurlausar sameiningargreiningar saman á grundvelli skarast svæða þeirra. | Suspencewl / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mapping_Reads.png) frá Wikimedia Commons
Höfundur : Milos Pawlowski
Ummæli
Skrifa ummæli